L'incidence du paludisme est de 681 pour 1000 habitants en 2024 dans le département de l'Atacora(données issues de la production du Programme national de Lutte Contre le Paludisme). Bien que cette valeur constitue une contre  performance pour l'atteinte des valeurs minimale et maximale de la cible fixée (215-80), elle tend à la baisse les efforts fournis dans le département par rapport à la  valeur de 2023 (249,07 pour mille habitants) selon l'annuaire des statistiques sanitaires (2023). Pour baisser considérablement la tendance, il urge de renforcer le dispositif de prévention contre le paludisme (Le vaccin contre le paludisme chez les enfants de moins de 5 ans, l'utilisation des MILLD, la chimio prophilaxie saisonnière (CPS) et l'hygiène)