L’indice de parité fille/garçon mesure le rapport entre le nombre de filles scolarisées et le nombre de garçons scolarisés dans le secondaire. Une valeur :
• égale à 1 indique l’égalité parfaite entre filles et garçons,
• inférieure à 1 signifie que les filles sont moins nombreuses que les garçons,
• supérieure à 1 indique une surreprésentation des filles.
En 2024, il atteint 92,04%, confirmant la tendance à la parité. Les principales mesures prises concernent :
• Subvention des frais de scolarité 1er cycle. Poursuite du fonctionnement des 8 Lycées des Jeunes Filles 
• Distribution de kits scolaires aux apprenants des zones déshéritées, à chaque rentrée, à travers le projet SWEDD financé par la BM et dont les activités ont commencé en 2017
• Programme CASH PLUS CARE de transfert monétaire à toutes les filles scolarisées âgées de 9 - 15 ans démarré en 2019 dans toutes les communes des 4 départements du nord sauf Parakou afin de répondre à une des causes profondes du mariage précoce qu'est la pauvreté et alléger directement la charge financière des ménages.
• Lettre n°063/SGM/MESTFP/SA du 16 février 2022 relative au rappel des acteurs des établissements d’ES sur les bonnes pratiques prescrites par l’arrêté n°2015 portant institutionnalisation des bonnes pratiques pour la protection contre les abus sexuels en milieux scolaires.